Matouš Pěruška ötéves korában kezdett hegedülni Harbi Shabu tanítványaként. Három év tanulás után Ludmila Stětinovához került, majd később az ő irányítása alatt folytatta tanulmányait a prágai konzervatóriumban is. A vizsgaelőadásán Brahms hegedűversenyének szólóját játszotta a konzervatórium prágai zenekarának kíséretével.

Egyetemi tanulmányait 2012-ben kezdte meg a prágai Zeneakadémián (Akademie múzických umění v Praze) a neves professzor, Leoš Čepický osztályában. A 2014/2015-ös és a 2016/2017-es tanév során Erasmus-ösztöndíjasként a bécsi Zene- és Előadóművészeti Egyetemen (Universität für Musik und darstellende Kunst) tanult a Bécsi Szimfonikusok koncertmesterének, Jan Pospíchalnak a vezetése alatt.

Matouš Pěruška 2013 és 2014 augusztusában részt vett a Bécsi Filharmonikusok mesterkurzusán is, ahol szólistaként és a kurzus résztvevőiből alakított kamarazenekar tagjaként két alkalommal is felléphetett a bécsi Musikverein koncertteremben. Ezenkívül olyan világszerte elismert tanárok mesterkurzusain is részt vett, mint R. Davidovici, M. Ericsson, I. Ženatý, V. Hudeček, M. Frischenschlager, J. Pazdera, M. Šetena, P. Götzel, Hagai Shaham, Ray Chan és Ivri Gitlis.

Matouš Pěruška számos cseh és nemzetközi versenyen is szerepelt. 2014 májusában Veronában megnyerte a hatodik Premio Francesco Geminiani nemzetközi versenyt. 2015 szeptemberében a pörtschachi Brahms-versenyen 2. helyezett lett, valamint elnyerte a közönségdíjat is. 2016 májusában első helyezést ért el a Paolo Serraóról elnevezett olaszországi nemzetközi zenei versenyen, legutóbb pedig – 2017 májusában – a Prágai Tavasz Nemzetközi Zenei Verseny döntőjébe jutott.

Rendkívüli kamarazenei tehetsége miatt gyakran hívják vendégelőadóként kamarazenei koncertekre. Emellett állandó tagja különböző kamarazenei formációknak – ezek közül talán az egyik legkülönlegesebb a Kristina Vocetková csellóművésszel alkotott duója.

A párost 2015 nyarán Kodály Zoltán-díjjal tüntették ki, továbbá a Bohuslav Martinů Alapítvány is két alkalommal díjazta őket. Számos cseh és nemzetközi verseny győztesei, valamint rendszeres fellépői Európa koncerttermeinek. Mestereik közül Pavel Hůla, Onczay Csaba és Peter Schuhmayer nevét érdemes kiemelni.

Matouš Pěruška 2012 és 2014 között a Cseh Filharmonikus Zenekar Zenekari Akadémiájának tiszteletbeli tagja volt.